El miércoles, 1 de abril de 1891salió a la calle el ejemplar n.º 1 en la ciudad de Burgos, inicialmente como diario de la tarde, sin publicación dominical, convirtiéndose en rotativo matutino más tarde. Siendo sus promotores y fundadores, el abogado, escritor, y periodista burgalés Juan Albarellos Berroeta, nombrado redactor Jefe, y Juan García Rubio, secretario de Sala de la Audiencia de Burgos, que en 1892 se desvinculó del diario, convirtiéndose Juan Albarellos en el único propietario, además de editor y director de la publicación que lo dirigió hasta su fallecimiento en 1922. Durante los quince primeros años, Félix García Carrasco fue su gerente. Al fallecimiento del fundador, le sucede su hermano, Ignacio Albarellos Berroeta, Ingeniero industrial y teniente coronel de Artillería, en la dirección y propiedad, ocupando el cargo de director hasta 1942.
La primera rotativa de impresión era una vieja máquina de origen francés (1860-1870) marca "Marinoni" movida manualmente, dos personas se necesitan para su correcto funcionamiento, una que acciona el volante y la otra alcanza y arrima las hojas de papel para que imprima, que se instaló en un chalet de la Avenida de la Isla n.º 1, en donde se ubicaba la Imprenta, Redacción y Administración, dos tipógrafos venidos de Madrid, dos escribientes sin sueldo fueron sus primeros recursos, realizando las primeras tiradas de unos trescientos ejemplares en formato A1. Su primer despliegue informativo de relevancia fue con motivo del choque de dos trenes en Quintanilleja (municipio de Villagómez).
El 7 de noviembre de 1892, las oficinas del periódico se trasladan de la calle la Isla n.º 1, a la calle Almirante Bonifaz, 7 y 9 (teléfono 165). Las instalaciones y el domicilio social se reubicaron años más tarde en la calle de Vitoria n.º 16 (hoy, 13, bajo).
En cuanto a la maquetación, propia de un órgano periodísticos de provincias, era de una precariedad y sencillez incuestionable, se aprecia la ausencia de separación entre secciones, y la falta evidente de grabados, dibujos y fotografías, que no se incorporan hasta 1933, y de forma discontinua. A partir del 2 de junio de 1940, el periódico cambia de formato, pasando del tipo grande, de sábana (como se conoce en el argot periodístico) al de tipo tabloide, pero de 6 columnas y no de 7 como los formatos mayores asabanados.
Durante el periodo de la Segunda República fue uno de los principales periódicos conservadores burgaleses —junto al tradicionalista “El Castellano”, es durante esta época cuando el célebre fotógrafo burgalés Federico Vélez González, conocido como "Fede", desarrolla su actividad fotográfica.
El 15 de agosto de 1963 se procede a inaugurar la nueva rotativa en un solemne acto con asistencia de las primeras autoridades burgalesas y el director general de Prensa, Manuel Jiménez Quílez, en representación de ministro de Información y Turismo, bendiciendo las instalaciones el obispo vicario capitular, Demetrio Mansilla Reoyo.
Desde marzo de 1942 y hasta su fallecimiento en 1978 ocupa la dirección editorial del periódico Esteban Sáez Alvarado y Ángel León Goyri (hermano de la poetisa María Teresa León) la gerencia y dirección administrativa, sucediéndole su hijo Ángel León Albarellos. Sucede a Esteban, Andrés Ruiz que fuera redactor Jefe y director de la “Hoja del Lunes”. Desde 1978 Andrés Ruiz Valderrama, y durante el centenario es director Vicente Ruiz de Mencía y como gerente Javier Gutiérrez. A Ruiz de Mencía le sucede Antonio Mencía, que había sido subdirector del periódico además de director del “Diario Palentino” y “La Estafeta de Navarra”, de donde llega de nuevo al “Diario de Burgos”. El 1 de enero de 2010 toma posesión del cargo como director el periodista Raúl Briongos Velasco, quien ocupaba el puesto de redactor jefe.
La propiedad del medio permaneció durante un siglo en manos de la familia del fundador, que en 1991 lo vendió al empresario Antonio Méndez Pozo (actual director del grupo Promecal -Promotora de Medios de Castilla y León-, al que pertenece el “Diario de Burgos” entre otros medios de comunicación).
El periódico además de una edición para Burgos cuenta con dos ediciones, una para la ciudad de Aranda de Duero (ciudad y comarca) y otra para Miranda de Ebro.
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